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每逢案件搜查都状况百出的警视厅搜查一课刑警—–南波阳人（田中直树）在某一天，被搜查一课长五十岚修（武田铁矢）给叫了过去。原来此前，南波的母校帝都大学法学系教授曾每逢案件搜查都状况百出的警视厅搜查一课刑警—–南波阳人（田中直树）在某一天，被搜查一课长五十岚修（武田铁矢）给叫了过去。原来此前，南波的母校帝都大学法学系教授曾受托负责《犯罪搜查百年史》的编修。然而上头却勒令中止制作，需要南波代为前往道歉。南波边嚷嚷着“我不是为了做这种事才当的刑警”边心不甘情不愿地提着伴手礼前往帝都大学。没想到却在那碰到了意料之外的案件。下任校长候补人选的医学系教授—–高寺保的尸体在讲台上被发现了！而且高寺的尸体是从讲台天花上被吊下来，帷幕上布满了耐人寻味的数字暗号……在这谜团重重的案发现场，出现了一个颇感兴趣地自言自语道“这个案件大有内幕”的男人。原来他正是南波此行要拜见之人—–上知天文下知地理的文科天才、别名“知识巨人”的宇野边叡古（藤木直人）。 南波所属的搜查一课立刻展开了搜查。却不料在案发现场发现了睿古常用的烟斗里的烟草！看来凶手是打算嫁祸于叡古……到底凶手的动机是什么，而又为什么要把叡古卷入案件当中呢？！试图解开案件隐情的睿古与助手阿苏藤太（白洲迅）共同开始解读暗号。另一方面，搜查一课把副校长—–户村麻美（浅野百合子）及与被害者争夺下任校长之位的几个相关者视为嫌犯，但搜查依然难有进展。 为了尽早解决案件，五十岚任命叡古为调查顾问。被搜查一课组长—–川添德治（宇梶刚士）吩咐盯着点的南波，处处跟叡古一同行动。这期间，帝都大学内发生了第二起教授遇害的案件！而且案发现场再次留下了不明所以的暗号…………详情